Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms