Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBBP8Q99708 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms