Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms