Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A9Q96Q91 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms