Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms