Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FGD4Q96M96 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms