Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms