Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms