Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD3Q96L08 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD3Q96L08 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD3Q96L08 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD3Q96L08 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD3Q96L08 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD3Q96L08 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD3Q96L08 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD3Q96L08 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD3Q96L08 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD3Q96L08 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD3Q96L08 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD3Q96L08 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD3Q96L08 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD3Q96L08 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD3Q96L08 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD3Q96L08 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms