Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms