Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
STAMBPL1Q96FJ0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAMBPL1Q96FJ0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms