Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 373.3 ms