Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms