Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms