Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms