Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms