Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms