Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC4Q92889 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC4Q92889 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERCC4Q92889 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERCC4Q92889 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERCC4Q92889 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERCC4Q92889 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERCC4Q92889 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERCC4Q92889 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms