Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms