Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX38Q92620 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms