Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms