Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD30

GPT2, Alanine aminotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPT2Q8TD30 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPT2Q8TD30 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms