Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms