Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM87AQ8NBN3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms