Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms