Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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