Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00518Q8N0U6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms