Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC117Q8IWD4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms