Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms