Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13LQ71F56 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms