Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms