Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEND4Q6ZU67 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEND4Q6ZU67 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEND4Q6ZU67 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms