Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPGS1Q6ZTW0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms