Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms