Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms