Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPNTQ6UXI9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms