Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW78

UQCC3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC3Q6UW78 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UQCC3Q6UW78 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UQCC3Q6UW78 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms