Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LETMD1Q6P1Q0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETMD1Q6P1Q0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms