Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms