Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KANK3Q6NY19 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KANK3Q6NY19 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KANK3Q6NY19 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KANK3Q6NY19 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KANK3Q6NY19 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KANK3Q6NY19 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KANK3Q6NY19 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KANK3Q6NY19 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KANK3Q6NY19 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KANK3Q6NY19 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KANK3Q6NY19 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KANK3Q6NY19 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KANK3Q6NY19 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KANK3Q6NY19 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KANK3Q6NY19 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms