Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGAP9Q5VTM2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGAP9Q5VTM2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGAP9Q5VTM2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGAP9Q5VTM2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGAP9Q5VTM2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGAP9Q5VTM2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGAP9Q5VTM2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGAP9Q5VTM2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGAP9Q5VTM2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGAP9Q5VTM2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGAP9Q5VTM2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms