Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf60Q5U649 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms