Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDGFL1Q5TGJ6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms