Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEND3Q5T5X7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms