Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms