Protein–RNA interactions for Protein: Q5PR19

Putative UPF0607 protein LOC392364, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5PR19 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5PR19 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5PR19 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5PR19 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5PR19 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5PR19 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5PR19 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5PR19 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5PR19 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5PR19 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5PR19 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5PR19 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5PR19 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms