Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms