Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms