Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms