Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms